京东商户可以通过以下步骤来设置支付密码：
1. 登陆京东商户账户：首先，打开京东商城官网或者手机APP，输入商户账号和密码登录到商户后台系统。
2. 进入支付账号管理：登录成功后，可以点击“我的账户”或“支付账号管理”等相关选项，进入到支付账号管理界面。在这个页面上，可以设置支付密码和进行其他支付账号相关操作。
3. 设置支付密码：在支付账号管理界面上，可以找到“设置支付密码”或者“修改支付密码”等选项，点击进入到支付密码设置页面。在支付密码设置页面上，可以输入原密码（如果已经设置了支付密码）、新密码和确认新密码，然后点击确认进行保存。
4. 安全保护：在设置支付密码的过程中，京东商户还可以选择设置安全保护功能，比如设置支付密码提示问题、绑定手机验证等功能，以增加支付账号的安全性。
5. 完成设置：最后，点击保存或确认按钮，就可以完成支付密码的设置。设置完成后，商户可以使用这个支付密码来进行各种支付操作，如下单购买商品、支付订单、提现等。
需要注意的是，支付密码是非常重要的安全信息，商户应当妥善保管，并且不要轻易透露给他人。如果忘记了支付密码，可以选择通过手机验证或其他方式找回密码。另外，定期更改支付密码也是一种有效的安全措施，可以降低支付账号被盗用的风险。希望以上介绍对于京东商户设置支付密码有所帮助。
