淘宝联盟的佣金设置生效时间取决于不同的情况。一般来说，佣金设置的生效时间有以下几种情况：
1. 即时生效：有些佣金设置会立即生效，当你设置好了佣金比例或者固定金额后，系统会立即按照新的设置来计算佣金。这种情况一般适用于普通的商品佣金设置。
2. 审核后生效：有些佣金设置需要经过淘宝联盟的审核才能生效。一般情况下，审核的时间较短，通常在1-3个工作日内审核完成。审核通过后，新的佣金设置才会生效。
3. 生效时间设定：淘宝联盟也提供了设置佣金生效时间的功能。你可以在设置中指定佣金生效的具体时间，比如可以选择在某个未来的日期生效，这样来调整佣金的变化。
总的来说，淘宝联盟的佣金设置多久生效取决于具体的设置内容和审核过程。建议你在设置佣金时仔细查看相关规定，以确保设置的佣金能够按时生效并正常运作。如果有任何疑问，也可以联系淘宝联盟的客服人员进行咨询。希望以上信息对你有所帮助。