京东快递与商家合作的费用因合作方式、规模和订单量等因素而有所不同。通常情况下，京东快递会根据商家的具体需求制定不同的合作方案和收费标准。
一般来说，京东快递与商家合作的费用主要包括以下几个方面：
1. 合作费用：即商家与京东快递签订合作协议时需要支付的费用。这部分费用包括一次性费用和年度费用，具体金额取决于商家的合作需求和合作规模。
2. 进店费用：商家如果选择将商品存放在京东快递的仓库中，则需要支付进店费用。这部分费用通常按照存储时间和仓库面积等因素进行计算。
3. 物流运费：商家在使用京东快递服务时需要支付的物流运费。运费的计算取决于商品的重量、体积和配送区域等因素。
4. 售后服务费用：商家如果需要京东快递提供售后服务，例如包裹回收、换货等，可能需要支付相应的服务费用。
除了以上费用外，商家还需要考虑到京东快递可能会根据市场的变化和业务需求进行调整费用标准的可能性。因此，在选择与京东快递合作之前，商家需要充分了解京东快递的合作政策和费用标准，并根据自身情况进行综合考虑和决策。
总的来说，京东快递与商家合作的费用是一个灵活的、双向的协商过程。商家应该根据自身的经营需求和预算情况，与京东快递进行沟通和协商，制定适合双方的合作方案和费用标准。只有双方能够达成一致意见，合作才能够有利于双方的长期发展。
